Шахов Борис Евгеньевич родился 24 июня 1950 года в городе Макарьеве Костромской области.

В 1967 году поступил на лечебный факультет Горьковского медицинского института имени С.М. Кирова, по окончании которого в 1973 году рекомендован на должность рентгенолога в 5-ю городскую клиническую больницу.

В 1975 году прошел обучение в Институте сердечно-сосудистой хирургии имени А.Н. Бакулева в Москве и в 1978 году возглавил одно из первых в стране отделений рентгенохирургии, открывшееся на базе Горьковского кардиохирургического центра.

Защитил кандидатскую диссертацию «Состояние коронарного русла у больных с аневризмой сердца» в Научно Исследовательском Институте сердечно-сосудистой хирургии в 1979 году.

Докторскую диссертацию «Рентгенодиагностика сложных врожденных пороков перегородок сердца» защитил в 1988 году в Научно Исследовательском Институте медицинской радиологии академии медицинских наук СССР в Обнинске.

Тогда же стал проректором по научной работе.

В 1989 году возглавил кафедру лучевой диагностики факультета усовершенствования врачей, в 1991 году ему присвоено звание профессора. Избран ректором в феврале 2007 года.

Один из основателей нового научного направления в России - интервенционной кардиологии.

Другие направления деятельности: рентгенокардиология, рентгенопульманология, рентгеноурология. Создал Нижегородскую научную школу рентгенохирургов. Автор девяти изобретений, более 170 опубликованных научных работ, в их числе 10 монографий и девять пособий.

Под его руководством защищено 12 докторских и 18 кандидатских диссертаций.

Ректор Нижегородской государственной медицинской академии. Заслуженный деятель науки Российской Федерации, академик Российской академии медицинских наук, доктор медицинских наук, профессор, член совета Ассоциации радиологов России в Ассоциации рентгенохирургов России, Межведомственного совета Министерства здраоохранения и Российской академии медицинских наук по секциям «Сердечно-сосудистая хирургия» и «Лучевая диагностика и лучевая терапия».

Председатель Нижегородского отделения Лиги здоровья нации и областного общества рентгенологов, специализированного ученого совета по защите лекторских диссертаций при Нижегородской государственной медицинской академии.

Член редакционной коллегии трех ведущих журналов России по лучевой диагностике.

Награжден серебряной медалью имени академика И.П. Павлова «За развитие медицины и здравоохранения», медалью В.К. Рентгена Европейской академии естественных наук в Ганновере «За особые заслуги в области научных исследований».

Лауреат премий Нижнего Новгорода в 1993, 2003, 2004 годах.

Отмечен почетной грамотой Министерства образования и науки Нижегородской области «За активную работу с талантливой научной молодежью», благодарностью государственной администрации Нижегородской области «За добросовестный труд».

Лауреат премии Правительства в области образования за 2011 год.