Баграт Алекян родился 15.04.1951 в городе Ереван Армянской ССР.
В 1974 году окончил лечебный факультет Ереванского государственного медицинского института. С 1975 года по настоящее время работает в Научном Центре сердечно-сосудистой хирургии им. А.Н.Бакулева Российской Академии Медицинских Наук. За годы работы прошел все этапы трудового пути: начинал старшим лаборантом (1975-1976), затем являлся младшим научным сотрудником (1976-1980), старшим научным сотрудником (1980 – 1991), главным научным сотрудником (1991-1992). В 1980 году защитил кандидатскую диссертацию на тему «Коронарное русло, гемодинамика и сократительная функция миокарда у больных ишемической болезнью сердца с постинфарктным кардиосклерозом в аспекте хирургического лечения», а в 1986 году – докторскую диссертацию «Современные аспекты диагностики полной транспозиции магистральных сосудов по данным рентгенохирургических исследований».
С 1992 года Баграт Алекян утвержден в должности руководителя отделения рентгенохирургических методов исследования и лечения заболеваний сердца и сосудов. За годы его руководства отделение выросло в крупный рентгеноэндоваскулярный центр страны, увеличился штат сотрудников, значительно возросло количество рентгеноэндоваскулярных диагностических и лечебных вмешательств. Баграт Алекян является пионером разработки многих специальных методик в эндоваскулярной хирургии. Им впервые в России выполнен ряд рентгенэндоваскулярных операций: закрытие открытого артериального протока с применением спиралей Gianturco, специальных механических окклюдеров Amplatzer и Sideris, закрытие дефектов межпредсердной и межжелудочковой перегородок посредством окклюдеров и целый ряд других рентгенэндоваскулярных вмешательств при сложных врожденных пороках сердца у новорожденных и грудных детей. Благодаря деятельности Баграта Алекяна в педиатрическую практику было внедрено стентирование сосудов при врожденных пороках сердца, которое позволило успешно оперировать пациентов, ранее считавшихся неоперабельными. Впервые в стране им также была выполнена операция стентирования внутренней сонной артерии у больных с хронической мозговой сосудистой недостаточностью и стентирование левой коронарной артерии у больных ИБС.
Впервые в мире у маленьких пациентов Баграт Алекян выполнил операции по закрытию дефекта аорто-легочной перегородки, фистулы между аортой и правым желудочком, а также патологического сообщения между легочной артерией и левым предсердием специальным устройством.
Плодотворные научные и лечебные исследования Баграта Алекяна нашли отражение в опубликованных десяти российских и двух зарубежных монографиях, большом количестве научных работ (более 700). Он подготовил 7 докторов и 40 кандидатов медицинских наук.
С 2002 года по настоящее время Баграт Алекян является Председателем Российского научного общества специалистов по рентгенэндоваскулярной диагностике и лечению. Он также является Председателем проблемной комиссии по эндоваскулярной хирургии Ученого Совета Министерства здравоохранения и социального развития Российской Федерации и Президиума Российской Академии Медицинских Наук, членом Редакционной коллегии журнала ”Asian cardiovascular and Thoracic annals“, «Journal of radiology and nuclear medicine» и многих центральных журналов нашей страны. Награжден двумя Государственными наградами Российской Федерации: в 1997 году медалью «850-летия Москвы», в 2006 году орденом Дружбы. В 2000 году Баграт Алекян был награжден серебряной медалью им. В.И. Бураковского за выдающиеся успехи в области подготовки молодых специалистов для сердечно-сосудистой хирургии, в 2001 году - Премией им. В.И. Бураковского с вручением золотой медали за выдающиеся достижения в области рентгенохирургического лечения сердечно-сосудистых заболеваний. В 2010 году награжден премией «Врач-года». В 2005 году он был избран член-корреспондентом РАМН.
При активном участии Баграта Алекяна в 2009 году в Российской Федерации была утверждена новая специальность «Рентгенэндоваскулярные диагностика и лечение», а он был назначен главным внештатным специалистом Министерства Здравоохранения и Социального Развития Российской Федерации по рентгенэндоваскулярным диагностике и лечению.
Баграт Алекян ведет большую педагогическую работу, является профессором кафедры сердечно-сосудистой хирургии № 2 Sechenov University.
